微生物生態學、多源基因體學、環境病毒學

生物資訊、比較基因體學、資料探勘

天然物及中草藥開發、應用基因轉殖植物進行天然藥物開發

心肌梗塞與心肌肥厚之藥物研發、治療粥狀動脈硬化與血管瘤之藥物研發、抗血管細胞增生藥物之研究

Environmental health, Aquatic system monitoring, Ecotoxicology

天然藥物藥效評估、天然藥物藥理學、天然藥物生物技術

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珊瑚礁生物商業量產模式與產學合作

水產養殖學、海洋生態學、仔稚魚培育技術、水族博物館學

河川魚類及甲殼類生態調查、淡水蝦類分子地理類緣關係之研究

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海洋污染生物監測、海洋生物健康評估、珊瑚環境毒理學

保育類海洋生物臨床研究與看診、救傷海龜的照護及管理

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底棲無脊椎生物多樣性、演化、親緣地理學

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